La microbiota intestinal juega un papel cada vez más aparente en el desarrollo de distintas enfermedades nutricionales, ya que el desequilibrio de dichos organismos puede alterar el metabolismo energético y predisponer a desarrollar estos trastornos. Se sabe que, en el adulto, una diversidad disminuida en la microbiota intestinal, se asocia a estados patológicos, como la obesidad. Objetivo: Relacionar el z-score del IMC con la cantidad de colonias bacterianas intestinales en una muestra a conveniencia de 20 niños de edad preescolar que asisten a un jardín de niños de bajos recursos económicos en la comunidad de Jocotán, Jalisco. Método: El análisis consistió en mediciones antropométricas e identificación de bacterias procedentes de muestras fecales utilizando el kit RapidIDTM ONE System. Se utilizó el coeficiente de correlación de Pearson y Spearman para evaluar si existe una correlación entre el número de colonias en las heces y el estado nutricional de los niños. Resultados: Predominaron los niños con un z-IMC normal según la OMS y no se obtuvo una correlación significativa entre el z-IMC y la cantidad de colonias. Conclusión: No se encontró correlación significativa entre el valor de z-IMC y la cantidad de colonias en las heces de los niños.